Osobną częścią Europejskie Centrum Zdrowia Otwock jest Centrum Kształcenia Komplementarnego w Medycynie (CKKwM) umożliwiające prowadzenie kursów doskonalących dla kadr medycznych w postaci szkoleń lekarzy, pielęgniarek oraz osób zawodowo związanych z administrowaniem w służbie zdrowia. Oferujemy także szkolenia spoza branży medycznej, jednak mające wpływ na kliniczną i teoretyczną stronę medycyny.
W ramach CKKwM działa wyposażony w nowoczesne symulatory i połączony światłowodami z blokiem operacyjnym Instytut Wirtualnych Technik w Medycynie.
Odrębnym działem placówki jest także Centrum Medycyny Doświadczalnej, w której nauka styka się medycyną, a medycyna z teorią i praktyką.